1. 染色体核型分析：细胞培养→中期染色体制片→G显带染色→显微镜下观察染色体数目、结构形态。

2. FISH：荧光标记特异性基因探针，与染色体靶序列原位杂交，荧光信号定位计数，检测特定片段缺失/重复/易位。

3. CMA染色体微阵列：基于芯片高通量检测全基因组拷贝数变异（CNV），比对正常参照基因组，识别微缺失、微重复。

4. WES全外显子测序：捕获人类全部编码区外显子序列，高通量测序，检测点突变、小片段插入缺失、单基因病致病变异。

2. 检测分辨率

• 核型：5–10 Mb，仅能检出大片段染色体异常

• FISH：kb级，靶向位点分辨率高，局限探针覆盖区域

• CMA：10–100 kb，全基因组无死角，检出微缺失微重复

• WES：单碱基级别，可识别点突变、小Indel

3. 检测异常类型

• 核型：染色体数目异常、大片段结构异常（易位、倒位、大片段缺失重复）

• FISH：靶向微缺失/微重复、染色体非整倍体、特定基因扩增（如HER2）、嵌合体

• CMA：全基因组CNV（微缺失、微重复、致病性拷贝数变异），检出核型漏诊的微小结构异常

• WES：单基因病点突变、小片段插入缺失、复合杂合变异、孟德尔遗传病，不常规检出大片段CNV

4. 检测范围

• 核型：全染色体宏观结构+数目

• FISH：靶向有限位点，需预先怀疑特定疾病

• CMA：全基因组拷贝数变异，无预设靶点

• WES：全部基因编码区，覆盖数千种单基因病

5. 检测周期

• 核型：7–14天（需细胞培养）

• FISH：1–3天（无需培养，间期细胞即可）

• CMA：3–7天

• WES：10–20天（测序+生信分析+变异解读）

6. 样本要求

• 核型：必须活细胞（外周血、羊水细胞、绒毛细胞，需培养）

• FISH：间期/中期细胞均可，新鲜组织、羊水、绒毛、外周血均可

• CMA：无需活细胞，外周血、羊水、绒毛、流产组织均可，DNA即可

• WES：外周血、羊水、绒毛、家系样本，高纯度基因组DNA

7. 嵌合体检出能力

• 核型：低比例嵌合体（＜10%）易漏诊

• FISH：可检出低比例嵌合体，灵敏度高

• CMA：可检出一定比例嵌合体，低于FISH

• WES：嵌合体检出能力弱，仅高比例可识别

8. 临床适用场景

• 核型：产前基础诊断、反复流产、染色体大结构异常筛查、遗传咨询基础检测

• FISH：快速产前三体筛查、已知微缺失综合征靶向验证、肿瘤基因扩增、植入前胚胎快速检测

• CMA：不明原因智力低下、发育迟缓、多发畸形、核型正常的不良孕史、产前超声异常一线诊断

• WES：不明原因罕见病、多发畸形排除CNV后查单基因病、家系遗传咨询、优生优育、疑难儿科遗传病

9. 局限性

• 核型：分辨率低、耗时、依赖技师经验、漏诊微缺失微重复

• FISH：只能查探针指定区域，不能全基因组筛查，未知变异无法检出

• CMA：不能检出平衡易位、倒位、点突变，临床意义不明CNV（VOUS）解读困难

• WES：不覆盖非编码区、难检出大片段CNV和平衡结构异常、变异解读复杂、成本高、周期长

10. 成本费用

由低到高：核型 ＜ FISH ＜ CMA ＜ WES

11. 对操作人员及设备依赖

• 核型：高度依赖细胞培养及阅片技师经验

• FISH：依赖探针设计及荧光显微镜判读

• CMA：依赖芯片平台与生信分析

• WES：依赖高通量测序平台、生物信息分析、遗传咨询师变异解读