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IgG4相关性疾病的外周血、颌下腺组织差异表达基因筛选
作者: 沈欣瑀
单位: 海军军医大学基础医学院

摘要

通过分析IgG4相关性疾病外周血样本和颌下腺(submandibular gland,SMG)样本中疾病相关差异表达基因(differentially expression genes,DEGs)及对应细胞通路,探究IgG4-RD发生发展过程中的分子免疫机制。

从基因表达综合数据库(gene expression omnibus,GEO)下载基因表达谱数据GSE66465及GSE202615,使用R 4.4.2进行数据处理,运用String数据库构建蛋白互作网络,并以Cytosapce 3.10.0软件得到关键基因。


①GSE202615数据集上调基因1448个,下调基因1588个;GSE66465数据集上调基因353个,下调基因410个;②功能富集解析显示共同差异基因主要发挥参与免疫反应的细胞活化,MAPK级联负调控等功能;③根据PPI蛋白互作网络得到13个关键靶基因:CCL3,IL-10,SMAD7,TFRC,RGS1,HMOX1,IGF1R,TIMP1,PPARG,IFNG,PRDM1,CXCR4


能富集解析显示共同差异基因主要发挥参与免疫反应的细胞活化,MAPK级联负调控等功能。这为我们下一步探究分子机制提供理论依据。

关键词: IgG4相关性疾病;生物标志物;外周血;颌下腺;基因
来源:中华医学会第二十八次风湿病学学术会议