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原发性干燥综合征致病基因的生物信息学分析
作者: 王赟
单位: 天津市第一中心医院

摘要

利用生物信息学方法筛选pSS可能的致病基因,以探索可能的发病机制。

从GEO数据库下载2个基因表达数据集,整合数据集后获取差异表达基因,并对其进行富集分析、PPI互做网络构建及hub基因筛选。

共鉴定出29个差异基因(27个上调基因和2个下调基因)。GO富集结果显示这些基因参与淋巴细胞及单核细胞的分化增殖、T细胞活化、细胞-细胞间黏附的正向调节等生物学过程和趋化因子相关的分子功能。KEGG分析主要涉及趋化因子信号通路、造血细胞调控信号通路、B细胞受体信号转导、病毒蛋白与细胞因子及受体相互作用通路。从PPI网络中筛选出5个hub基因MX1、SELL、IFIT1、IFI44L、SAMD9L。

利用生物信息学分析,确定了MX1、SELL、IFIT1、IFI44L、SAMD9L基因,可能参与了pSS发病。

关键词: 原发性干燥综合征;生物信息学;差异基因
来源:中华医学会第二十八次风湿病学学术会议