1. 核心原理

染色体核型分析：细胞培养后，在显微镜下对中期分裂相染色体进行条带染色，观察数目和结构。

荧光原位杂交（FISH）：采用荧光标记的DNA探针，与间期或中期细胞特异性结合，定位特定DNA序列。

染色体微阵列分析（CMA）：将待测DNA与芯片上的探针杂交，通过信号强度比较，判断全基因组拷贝数变化。

全外显子分析（WES）：高通量测序捕获全部外显子区（约占基因组1-2%），检测序列变异。

 2. 分辨率

核型：低，检出阈值需5-10 Mb。

FISH：高，针对特定探针，可达kb级。

CMA：高，取决于探针密度，一般50-100kb，高密度芯片可低于10kb。

WES：单碱基级，可检测点突变。

3. 主要检测变异类型

核型：整倍体非整倍体、大片段缺失/重复、平衡易位/倒位、标记染色体。

FISH：特定非整倍体、已知微缺失/重复（如22q11.2）、基因扩增（如HER2）。

CMA：主要检测全基因组内的微缺失/微重复、染色体杂合性缺失（包括单亲二体、血缘同源）。不能检测平衡易位/倒位、低比例嵌合（一般低于20%）。

WES：主要检测单核苷酸变异、小片段插入缺失。不能检测非编码区变异、动态突变（如三核苷酸重复）、大片段拷贝数及平衡易位（除非生物信息学辅助）。

4. 技术限制

核型：需新鲜活细胞，培养周期长（10-14天）；失败率高；对嵌合体比例要求 >10-15%（不同实验室可能差异较大）。

FISH：仅探针靶向区域；不能发现非预设异常；背景荧光干扰。

CMA：无法检测低比例嵌合（若比例足够高仍可检出，具体阈值因平台而异，通常低于10-20%敏感度下降）；无法检测平衡性重排；可能检出临床意义不明确的变异。

WES：覆盖度不均可能漏检；无法检测内含子/调控区变异；数据分析复杂。

5. 检测时间

核型：10-14天（快检技术可缩短，但未普及）。

FISH：24-48小时。

CMA：3-5天。

WES：2-6周（取决于是否采用快速流程）。

6. 样本要求

核型：需活细胞（外周血、羊水、绒毛、组织）；不能使用降解/固定样本。

FISH：可固定细胞（羊水、血涂片、石蜡切片）。

CMA：DNA（常规、微量）；可接受降解样本。

WES：DNA（常规、微量）；可接受降解样本。

7. 成本与可及性

核型：低成本，广泛可及。

FISH：中高成本（单探针或少量探针组合），较大型医院可及。

CMA：较高成本，多需外送参考实验室。

WES：高成本（近年单价下降，但仍高于多数染色体检测），需专门生信分析。

8. 临床典型用途（产前/遗传病）

核型：产前初步筛查（唐筛高风险、高龄）、流产组织分析、白血病分型（但急性早幼粒细胞白血病分型及监测已更多采用FISH或实时定量PCR）。

FISH：快速产前诊断（13/18/21/X/Y），微缺失综合征快速验证。

CMA：核型正常的超声异常、多发畸形/发育迟缓（儿科）、全基因组微缺失/重复筛查。

WES：多种表型但上述检测阴性，拟诊单基因病。

9. 对重要特定异常的检测能力

平衡易位：仅核型可明确；其他均无法可靠检出。

单亲二体：仅CMA（需具备SNP探针）或甲基化分析；核型/FISH/WES不能常规检测（WES需特定分析流程）。

嵌合体：核型（低比例易漏），FISH（可定量数百细胞），CMA（较低比例易漏）。

低比例嵌合（<10-20%）：仅FISH（计数足够细胞）可能可靠；其余三种均易漏诊。