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刘盈，密云区医院
作者： 刘盈
单位： 北京市密云区医院
摘要
| 维度 | 染色体核型分析 | 荧光原位杂交（FISH） | 染色体微阵列（CMA） | 全外显子测序（WES） |
|---|---|---|---|---|
| 检测原理 | 显带染色 + 显微镜观察 | 荧光探针杂交 + 信号计数 | 全基因组芯片 + CNV 分析 | 外显子捕获 + 高通量测序 |
| 核心检测 | 整条染色体数目 / 大结构异常 | 特定区域缺失 / 重复 / 数目 | 全基因组 CNV/LOH/UPD | 外显子点突变 / 小 Indel |
| 分辨率 | 低（5–10 Mb） | 中（100 kb–5 Mb） | 高（50 kb–1 Mb） | 极高（单碱基） |
| 基因组覆盖 | 全染色体（低分辨） | 靶向区域（有限） | 全基因组（高分辨） | 仅编码区（~1%） |
| 平衡易位 / 倒位 | ✅ 可检测 | ❌ 漏检 | ❌ 漏检 | ❌ 漏检 |
| 点突变 / 小 Indel | ❌ 不能测 | ❌ 不能测 | ❌ 不能测 | ✅ 全检测 |
| LOH/UPD | ❌ 不能测 | ❌ 不能测 | ✅ 可检测 | ⚠️ 有限检测 |
| 周期 | 7–14 天（需培养） | 1–3 天（快速） | 3–7 天 | 7–14 天 |
| 通量 | 低 | 中 | 高 | 高 |
| 技术门槛 | 低（依赖人工） | 中（自动化） | 高（生物信息分析） | 极高（测序 + 解读） |
| 临床首选场景 | 产前初筛、反复流产、不孕 | 已知微缺失综合征、快速产前诊断 | 不明原因发育迟缓、多发畸形、CMA 一线 | 罕见病、疑难病、CMA 阴性病例 |
| 成本 | 最低 | 中等 | 较高 | 最高 |
1. 分辨率与检测范围（核心差异）
核型：看 “染色体轮廓”，只能抓大问题（如整条染色体多一条、大片段缺失）。
FISH：看 “特定基因位点”，只能查已知小片段问题（如 22q11 微缺失），像 “定点抽查”。
CMA：扫 “全基因组细节”，无死角查所有 CNV，分辨率够高，是目前产前 / 儿科一线。
WES：读 “基因编码区字母”，精准抓单碱基错误，解决单基因罕见病。
2. 临床应用选择逻辑
初筛 / 便宜优先：选核型（唐氏筛查高风险、反复流产）。
已知综合征 / 快速出结果：选FISH（如 22q11、15q11、胎儿快速诊断）。
不明原因发育迟缓 / 多发畸形：选CMA（一线），性价比最高，全基因组高分辨。
CMA 阴性仍高度怀疑遗传病因：选WES（罕见病、疑难病）。
3. 局限性互补（无完美技术，常需联合）
核型 + FISH：核型查大异常，FISH 补特定小缺失，适合产前快速诊断。
CMA+WES：CMA 查 CNV，WES 查点突变，覆盖绝大多数遗传病因，是罕见病诊断金标准组合。
