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基于转录组与机器学习分析鉴定种植体周围炎相关的关键泛凋亡基因
作者: 张润澈
单位: 杭州师范大学附属医院

摘要

种植体周围炎是一种由微生物感染及宿主免疫反应异常共同导致的慢性炎症性疾病,其特征为种植体周围骨吸收及软组织破坏,是影响种植体长期稳定性的主要原因之一。近年来,研究发现泛凋亡(PANoptosis)在多种炎症性疾病和免疫失衡过程中发挥关键作用。然而,其在种植体周围炎发生发展中的作用机制尚未得到系统阐明。

本研究基于公开转录组数据集,筛选出种植体周围炎与健康对照组织间的差异表达基因,并与已知泛凋亡基因集交集获得泛凋亡相关差异基因(PAN-DEGs)。随后进行了基因本体(GO)与通路富集分析,以探讨其潜在的生物学功能。进一步采用LASSO回归和XGBoost算法进行机器学习特征筛选,以识别与种植体周围炎密切相关的关键泛凋亡基因。

GO富集分析显示,PAN-DEGs主要参与凋亡信号通路调控、细胞因子生成的正向调控、以及免疫相关反应等生物学过程。机器学习分析进一步确定,MSH2和ADAM8在模型中具有最高的预测贡献,提示这两个基因可能在种植体周围炎相关的细胞死亡与免疫调控过程中发挥核心作用。

本研究通过转录组分析结合多算法机器学习筛选,鉴定出与种植体周围炎密切相关的关键泛凋亡基因MSH2和ADAM8,为进一步探索种植体周围炎的免疫炎症机制提供了新的分子证据,并为潜在的早期诊断及靶向治疗提供了理论基础。

关键词: 泛凋亡,种植体周围炎
来源:中华口腔医学会口腔修复学专业委员会第19次口腔修复学学术会议