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lncRNA SNHG16编码的小肽在神经母细胞瘤中的作用和分子机制研究
作者: 王舜莹
单位: 复旦大学附属儿科医院

摘要

神经母细胞瘤(neuroblastoma, NB)是一类儿童常见的高侵袭性实体肿瘤,预后差且分子机制复杂。近年来,非编码区小开放阅读框(sORFs)及其编码的小肽逐渐受到关注,但在NB中的作用尚不清楚。本研究旨在通过翻译组学和蛋白组学联合策略发掘NB相关未注释小肽,并以lncRNA SNHG16为代表,验证其编码潜能,进一步探讨其在NB生物学行为中的功能与分子机制。

本研究收集外周神经母细胞性肿瘤(pNTs)临床样本及NB细胞系,利用Ribo-seq预测非编码区sORFs,并结合质谱进行小肽鉴定与验证。其次,基于TCGA数据库筛选预后相关lncRNA,结合外源性表达、融合标签验证及起始密码子突变实验,确定SNHG16转录本SNHG16_9是否具备编码能力,并分析其在临床样本中的表达特征。最后,构建小肽SNHG16-9过表达稳转株及CRISPR敲除株,通过细胞功能实验评估其对增殖、迁移和侵袭的影响,并通过Co-IP联合质谱和Western Blot探索其潜在分子机制。

翻译组学分析显示,不同危险分级的pNTs及NB细胞系存在差异性翻译特征。高危NB及MYCN扩增细胞系中非编码区ORF占比更高,部分lncRNA(如SNHG16、LINC00630、MEG8等)被预测可能编码小肽。进一步实验证实lncRNA SNHG16的转录本SNHG16_9可编码一条37aa的小肽,且定位于细胞核内。SNHG16_9在节细胞神经瘤中高表达,提示其可能具备抑癌作用。功能实验表明,SNHG16-9对NB细胞增殖的调控作用不一致,但其显著抑制细胞迁移和侵袭。机制研究提示SNHG16-9可与ANXA2等蛋白互作,并通过降低ANXA2的蛋白水平抑制肿瘤迁移侵袭能力。

本研究系统揭示了NB中存在一批来源于非编码区的潜在小肽,丰富了对pNTs翻译组学特征的认识。进一步确认lncRNA SNHG16的转录本SNHG16_9可编码一条37aa的小肽,并通过负向调控ANXA2发挥抑制NB迁移和侵袭的作用。该发现为NB的发生发展机制研究提供了新视角,并为小肽作为潜在生物标志物及治疗靶点奠定了基础。


关键词: 神经母细胞瘤、未注释小肽、翻译组学、开放阅读框、SNHG16
来源:中华医学会小儿外科学分会第二十次小儿外科学术年会暨第十四届小儿外科中青年医师学术研讨会