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原发性肾病综合征与系统性红斑狼疮的共同基因表达特征和分子机制
作者: 李小芬
单位: 柳州市人民医院

摘要

初步探究系统性红斑狼疮(systemic lupus erytematosus, SLE)和原发性肾病综合征(primary nephrotic syndrome, PNS)的共同基因表达特征和分子机制.

用基因表达综合数据库(Gene Expression 0mnibus,GEO)获取 SLE 和 PNS 基因表达数据集,进行差异表达基因分析(differenti-ally expressed genes,DEGs)和加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA),初步确认 SIE 和 PNS 的共同关键基因。进一步通过Gene Ontology(GO)和Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)富集分析及STRING数据库构建蛋白质互作网络,以识别共同驱动基因并分析其功能。

在SLE中鉴定出175个DEGs,包括139个上调和36个下调基因,而在PNS中鉴定出812个DEGs,包括376个上调和436个下调基因。通过WGCNA,在SLE数据中确定了16个基因表达模块,其中black模块与SLE显著相关;在PNS中识别出42个模块,其中lightsteelblue1模块与PNS显著相关。通过交集分析,我们识别出13个重叠的DEGs和1个共同模块基因。富集分析揭示了这些基因在皮质酮反应、免疫调节和细胞凋亡等生物过程中的显著作用。蛋白质互作网络分析显示FOS、FOSB、CCL2等基因在免疫应答中的关键作用。

研究揭示了SLE和PNS之间共有的基因表达模式和生物学途径,强调了免疫应答在两种疾病中的核心作用。特别是,FOS、FOSB、CCL2等基因在SLE和PNS的病理生理中的显著富集,表明它们可能在疾病发展中起到关键的调控作用,这为未来的机制研究提供了一定的参考。

关键词: 系统性红斑狼疮;原发性肾病综合征;炎症相关基因;加权基因共表达网络分析;差异表达基因分析
来源:中华医学会第二十八次风湿病学学术会议