目的：矮小症是儿童内分泌科常见的疾病之一，也是患儿及家长非常关注的问题。本研究通过二代测序技术对部分病因不明的矮小症患儿进行基因检测，旨在探讨儿童矮小症的遗传学病因。加深对儿童矮小症遗传病因的认识，避免盲目使用生长激素治疗。为今后儿童矮小症的精准诊疗提供参考。

方法：收集186例患儿临床资料，进行矮小相关基因的全外显子测序。根据患儿临床表型及有无矮小家族史进行分组，比较不同分组间基因检测的阳性率。     

结果：本研究共检测出69例阳性结果，总检出率37%。不同分组间基因检测阳性率比较显示：根据身高标准差分组：严重矮小（身高标准差＜-3SD）组阳性率（50%）、高于非严重矮小（身高标准差在-3SD~-2SD）组（31.5%）。根据有无骨骼发育异常分组：有骨骼发育异常组阳性率（60.9%）、高于无骨骼发育异常组（28.1%）。根据有无特殊面容分组：有特殊面容组阳性率（61.5%）、高于无特殊面容组（27.6%）。根据有无先天性心脏发育异常分组：有先天性心脏发育异常组阳性率（60%）、高于无先天性心脏发育异常组（33.5%）。是否为SGA分组：是SGA组阳性率（34.6%）、低于非SGA组（37.5%），但差异无统计学意义。根据伴有异常表型个数分组：伴有1个以上异常表型组阳性率（54.7%）、高于伴有1个异常表型组（47.5%）、高于无异常表型组（9.5%）。具有矮小家族史的患者身高标准差比较：身高标准差＜-4SD组阳性率（50%）、高于身高标准差在-4SD~-3SD组（30.8%）、高于身高标准差在-3SD~-2SD组（12.1%）。具有矮小家族史的患者否伴异常表型进行比较：有矮小家族史且伴有异常表型组阳性率（40.9%）、高于仅有矮小家族史不伴异常表型组（9.5%）。特殊面容和骨骼发育异常是儿童矮小症基因检测结果阳性发生的独立危险因素。

结论：全外显子测序技术是明确儿童矮小症遗传病因诊断的有效方法。对于传统诊断流程未能明确矮小病因的患儿，应关注骨骼生长板及综合征相关遗传缺陷对生长的影响。身材矮小的程度越严重的患儿，基因检测的阳性率越高。存在多系统异常的患儿，基因检测的阳性率高。对于仅有矮小家族史、而无其他异常表型的患儿，基因检测阳性率较低；当患儿有矮小家族史，且伴有其他异常表型，将提高基因检测的阳性率。身材矮小伴有特殊面容和（或）骨骼发育异常更可能存在基因变异的风险，对这类患儿应建议行基因检测明确病因。本研究共发现30种基因的53种不同变异位点，其中31个位点为新发现的变异位点，丰富了中国人群矮小相关基因突变谱。